随着气候的转冷，冬日将至。随着冬季的来临，农田的灌溉季也几乎接近结束。尤其是北方的种植区，为保证水肥一体化灌溉系统在下一个灌溉季可以正常的使用，需要对整个灌溉系统进行一次保养维护。
一、各级管道系统冲洗
节水灌溉系统在使用一段时间后，会有水垢和肥料残留附着在管壁和灌水器上，在一个灌溉季结束后，应在高压下冲洗管道，清除污垢，防止系统内的污垢在经过一个冬季后堵塞灌水器，从而影响下一个灌溉季的系统的使用。所以在一年之中最后一次灌水结束之后须对管道进行高压冲洗。
冲洗方法为：打开若干轮灌组阀门（少于正常轮灌阀门数），开启水泵，依次打开主管和支管的末端堵头及毛管，使用高压力逐个冲洗轮灌地块，力争将管道内的积攒的污物冲洗出去。然后把堵头装回，将毛管弯折封闭。
二、各级管道的排水
在管道冲洗完毕后，需要将管道内的存水排净，防治管道冻裂。尤其是在冻土层较深的地区，如黑龙江、内蒙古等地。在这些地区如果管道埋深不在冻土层之下，由于管路积水冻涨，发生管道的破损，这种情况往往难以发现，不能做出及时处理，从而影响下一个季度的灌溉用水。
目前国内灌溉工程多采用管路埋入当地冻土层以下，这样的结果是：系统比较安全，管理比较简单，只需冲洗无需排水，但工程量大、投资加大。如北京冻土层深在50cm-80cm，一般工程沟开挖深度在1m左右，新疆地区管路系统埋深一般在1.8m左右。
灌溉系统的排水，实际上是在冷冻出现以前，把管道、阀门、喷头里的水排出或采取保温措施，以防冻害对灌溉系统造成破坏灌溉系统的排水主要有三种方式：
1采用手动泄水措施释放灌溉系统里的水
使用这种办法，必须确信灌溉管道系统设计安装合理、能满足排水要求。手动泄水阀应安装在主管路相对低洼的地方，假若系统有多处低洼地，都应该设置手动泄水阀，一般采用球阀、闸阀或带有堵头的一段管子，而且应保证施工过程中有一定的坡度条件，方便管道内的水汇集到泄水井。若泄水井安装在室外，应保证泄水井的干燥（可以采用井底放置砾石）；若在室内应确保排泄的水量不致于溢出水井。
方法是：关闭系统主阀，切断水源，依次打开各轮灌区的控制阀，减少管路系统水压力，然后慢慢手动开启泄水阀。
2采用自动泄水措施释放灌溉系统里的水
灌溉管道系统主管路安装手动泄水阀为宜，而不要去采用自动装置。自动泄水装置一般安装在支管路。自动泄水装置往往为单项阀每次系统关闭后，自动泄水阀就会泄走管路里的水。自动泄水阀若安装在主管路系统会造成灌溉水的大量浪费。自动泄水阀应安装在分区的阀门下游低洼地，一般每条支管安装1-2个。在管理过程中，应定时检查，以防自动泄水阀堵塞而影响工作。
3采用压缩空气法吹出灌溉系统里的水
如果管道系统设计并没有设置泄水阀，或者泄水阀无法将管道内的水排净，则需采用空气压缩机吹出灌溉系统里的水。
采用压缩空气法，选择和使用适当的压缩空气流量是非常重要的。对于2"的管道，压缩空气流量大约需要134-170m3/h；对于3"的主管，压缩空气流量大约需要212m3/h；对于4"的主管，压缩空气大约可能需要424m3/h。管路设计上，需要预留压缩空气入口，一般采用在主管路上安装快速连接阀、手动闸阀或预留一些三通接口，这些预留口应紧挨着工程水源处。安装以后请及时检测一下安装情况和连接情况。使用压缩空气法时，采用定时器操作比手动操作安全，假如系统有定时器，请根据其提供的操作步骤进行。
首先关闭系统主阀，打开排水轮罐区阀门，减少主管路水压力，持续一段时间后关闭，利于水的排泄和空气的充分进入管路。连接压缩机与主管路的连接，注意调节阀门，使压缩空气压力不要超过0.35MPa。先关闭压缩机与主管道连接的阀门；打开压缩机，然后缓慢开启阀门，持续增加空气流量直到灌水器或者排水口正常出水，压缩空气的流量或体积取决于管路的长短和灌水器的数量。
每个轮灌区持续的时间不要超过2分钟，因为压缩空气持续的热量有可能破坏管路和管件。在空气压缩系统关闭以前一定不能关闭控制器。为了确保排空，可重复操作，直到喷头喷出的是雾汽，一般每个轮灌区可能需要重复2-3次。可以适当延长压缩机与灌溉系统之间连接管的距离，以便降低压缩空气温度；每个轮灌区排空以后，稍休息一段时间。以后的轮灌区工作时间应小于首次轮灌区，因为主管路系统已在首次排空。更换下一轮灌组排水时，需先打开另外一组轮灌区（需要排空的），重复上述步骤。
采用压缩空气法时，必须注意以下几点 
1） 压缩空气压力应保持在0.35MPa，但对PVC管道来说，压缩空气压力不可超过0.55MPa；对PE管道，压力大不能超过0.35MPa；注意：压缩空气压力应保持在0.35MPa，即使灌溉系统能承受1.0MPa的水压力，但在相同压力的空气作用下系统就会遭到破坏，因为空气的粘滞度比水的粘滞度小许多，能产生更大的威胁。建议采用压力调节阀以防止压力过高。若采用空气体积大、压力低的压缩空气，可消除一些潜在的隐患。不要试图用高压力、低容量的压缩空气来排空水，这非常危险。
2）压缩空气（压力0.35MPa以上）能破坏阀门、管路或由于一些飞溅物引起物理性伤害。在进行过程中，不要站在灌溉管路、喷头或电磁阀的周围。操作人员应配带保护眼镜，系统工作过程中请远离埋设管路、安装有喷头或电磁阀的地方，确保人身安全。
3） 空气压缩机必须有人看管，实时调节气压。
4）不能使用压缩空气对水泵排水。
5）支管系统操作完毕后，不要忘记把所有手动排水阀关闭。